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研究發(fā)現(xiàn)調(diào)控多能性細(xì)胞-體細(xì)胞轉(zhuǎn)變新機(jī)制

2021-08-10

  

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多能性狀態(tài)的退出或多能性細(xì)胞-體細(xì)胞轉(zhuǎn)變,是哺乳動物胚胎發(fā)育過程的重要事件,也是細(xì)胞命運決定研究的熱點。研究表明,該過程被高度調(diào)控,而非一個被動的事件,其分子機(jī)制存在未知。


     近日,中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院研究員劉晶課題組和西湖大學(xué)研究員裴端卿課題組合作,基于cJUN誘導(dǎo)小鼠胚胎干細(xì)胞多能性細(xì)胞-體細(xì)胞轉(zhuǎn)變細(xì)胞模型,發(fā)現(xiàn)了染色質(zhì)重塑復(fù)合物BAFs(Brg/Brahma-associated factors)的亞基SS18通過本身相分離性質(zhì)顯著調(diào)控這一過程。7月2日,相關(guān)研究成果以SS18 regulates pluripotent-somatic transition through phase separation為題,在線發(fā)表在《自然-通訊》上。

     科研團(tuán)隊早期發(fā)現(xiàn)原癌基因cJUN可快速誘導(dǎo)多能性狀態(tài)的退出(Jing Liu et al, Nature Cell Biology, 2015),基于此,構(gòu)建出可誘導(dǎo)多能性細(xì)胞-體細(xì)胞轉(zhuǎn)變細(xì)胞模型。研究基于CRISPR/Cas9的全基因組基因敲除的遺傳學(xué)篩選技術(shù)確認(rèn)了一系列候選基因,發(fā)現(xiàn)SS18基因的失活在轉(zhuǎn)錄組、克隆形成能力及干細(xì)胞克隆形態(tài)等方面顯著延遲多能性體細(xì)胞轉(zhuǎn)變進(jìn)程。同時,SS18的功能也可在其他多種多能性退出體系中得到驗證。

      研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),SS18蛋白在體內(nèi)可以發(fā)生液液相分離(Liquid-liquid Phase Separation, LLPS),表現(xiàn)在:SS18蛋白可在細(xì)胞核內(nèi)通過分子間弱相互作用形成微米級凝聚體;凝聚體內(nèi)部以及凝聚體內(nèi)和凝聚體外物質(zhì)可進(jìn)行交換;凝聚體可發(fā)生融合和分裂行為,且融合分裂時間與凝聚體大小成正比。SS18的液液相分離能力依賴于位于其羧基端的內(nèi)在無序區(qū)(Intrinsically Disordered Region, IDR),高度富集的酪氨酸發(fā)揮核心作用,酪氨酸的突變導(dǎo)致SS18蛋白無法形成凝聚體,并使SS18失去調(diào)控多能性退出的能力。SS18的IDR可被來自于其他蛋白的富含酪氨酸IDR(如FUS和TAF15)及多聚酪氨酸多肽替代,而非酪氨酸富集的IDR(如BRD4及MED1)則不能進(jìn)行功能替代。

      針對SS18的相分離行為是如何調(diào)控多能性退出的具體機(jī)制,科研人員展開機(jī)制研究。已有研究表明,SS18蛋白是染色質(zhì)重塑復(fù)合物BAFs的穩(wěn)定亞基。在胚胎干細(xì)胞中,BAFs主要分為三種亞型,即經(jīng)典BAF(canonical BAF,cBAF)、非經(jīng)典BAF(non canonical BAF,ncBAF)及PBAF(Polybromo-associated BAF)。它們含有一些共有成分如SMARCD1及BCL7A/B/C等,也分別含有其特異性亞基。研究表明,SS18形成的蛋白凝聚體可以富集cBAF特異性亞基而排斥PBAF特異性亞基,起到促進(jìn)或抑制相應(yīng)BAF亞型裝配的功能,而不同亞型的BAFs在多能性體細(xì)胞轉(zhuǎn)變中的作用卻不同。因此,SS18蛋白的缺失會打破BAFs各亞型之間裝配的平衡,并影響多能性細(xì)胞-體細(xì)胞轉(zhuǎn)變進(jìn)程。
來源:生物谷